• 課程安排

    推薦動植物研究者參加;不適合醫學從業者參加;合適零基礎學員參加;

    通過五天的學習可自行完成重測序的基本分析,掌握群體遺傳學分析、關聯分析等

    課前預習

    預習視頻并安裝軟件

    1. 視頻課程:《生物信息入門之 Linux》

    2. 視頻課程:《生物信息軟件安裝》

    3. 視頻課程:《測序數據過濾和質控》

    4. 個人電腦安裝:MobarXterm、FileZilla、IGV

    第一天

    Linux 基礎

    1. illumina 測序原理

    2. Linux 常用命令

    3. 生物信息軟件安裝

    4. 任務實操:測序數據過濾和質控

    第二天

    重測序基礎分析:變異檢測

    1. 測序數據比對到參考基因組:bwa、samtools 等

    2. 變異檢測:使用 GATK 進行 SNP/INDEL 檢測

    3. 變異注釋:預測變異對功能的影響

    4. 格式解讀:sam/bam、vcf/bcf、ped/bed

    5. 常用工具:vcftools、bedtools、picard、plink等

    第三天

    群體結構分析:探索不同亞群、品系之間的進化關系

    1. 群體進化樹構建

    2. 群體 Structure

    3. 連鎖不平衡分析

    第四天

    群體選擇分析:探索選擇與馴化在基因組上留下的印記

    1. 單群體多樣性參數:π、Tajima'D

    2. 群體間差異選擇區域分析:Fst

    第五天

    群體關聯分析:探索基因與性狀的關聯

    1. GWAS:全基因組關聯分析

    2. BSA:基于混池測序的基因定位

  • 往期精彩

    學習知識 結交朋友

  • 報名費用

    單期

    4500/人

    • 前10人優惠 500元
    • 老學員優惠 500元
    • 老學員推薦優惠100元
    • 3人組團,每人優惠300元;5人組團,每人優惠500元;
    • 以上優惠不可疊加。

    超級會員

    10900/人(原價14800/人)

    • 可參加1年內所有培訓班
    • 承諾1年內舉辦培訓班不少于 10 期
    • 郵遞1年內內所有培訓班教材
    • 有效期從參加第一期培訓班開始計算
  • 報名

    提前報名,享受優惠,報名后會發送資料至郵箱

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